Otomatik panjurlara bir uzaktan kumanda kontrol sistemi entegre edilerek daha pratik ve konforlu bir kullanım sağlanabilir. Kumandalı otomatik panjur sistemi kumanda üzerinden istenildiği anda panjuru açma – kapama, zaman ayarı yapılarak panjurların otomatik olarak kendiliğinden kapanıp açılması gibi son derece kullanışlı fonksiyonlara sahiptir. Genellikle motorlu panjurlarda en çok tercih edilen kontrol sistemi uzaktan kumandalı panjur sistemleridir.
Kumandalı panjurlar özellikle hareket güçlüğü çeken hastalar, evde panjur sistemini kontrol edemeyecek çocuğu veya yaşlısı olup kendisi evde olmasa bile zaman ayarı kullanarak kontrol sağlamak isteyenler, yoğun çalışma hayatı olanlar gibi pek çok kişi tarafından tercih edilmektedir.